• Mon GéoSource
  •  
  •  
  •  

DCSMM2018 - HP - D1C6 - Ratio de la concentration de surface en chlorophylle a contenue dans les dinoflagellés sur celle contenue dans les diatomées (2012-2016)

Le critère de définition du bon état écologique pour le descripteur D1 – Habitats pélagiques est le critère D1C6 : « les caractéristiques du type d'habitat, notamment sa structure biotique et abiotique et ses fonctions, ne subissent pas d'effets néfastes dus à des pressions anthropiques ». Un des indicateurs retenus, développés pour les communautés phyto- et zooplanctoniques, est l’indicateur PH1, basé sur la dynamique comparée de groupes fonctionnels (ou paires de formes de vie). Les échelles d’évaluation géographiques considérées sont les masses d’eau côtières de la Directive Cadre sur l’Eau (DCE) à la côte et les paysages marins mensuels au large, combinés sur une seule couche annuelle pour les besoins de l’évaluation. Le PH1 est en cours de développement et d’adaptation aux données disponibles dans les SRM, la période de référence et les seuils restent à définir pour cet indicateur. L’évaluation du bon état écologique n’a donc pu être effectué pour ce premier cycle DCSMM.

Les données sont présentées sous la forme de fichiers géoréférencés de type shapefile.

Simple

Date ( Création )
2018
Identificateur
DCSMM2018_CNRS_HP_D1C6_CHLOROPHYLLE_A_RATIO
Identificateur
DOI:10.12770/921f5fbb-4fca-49e7-ba1c-8ef2a9dbdcdd
Reconnaissance
CNRS
Auteur
CNRS - Marie Duflos
Auteur
CNRS - Guillaume Wacquet
Auteur
CNRS - Anaïs Aubert
Auteur
CNRS - Isabelle Rombouts
Auteur
CNRS - Benoit Mialet
Auteur
Ifremer - David Devreker
Auteur
Ifremer - Alain Lefebvre
Auteur
CNRS - Luis Felipe Artigas
Editeur (publication)
Ifremer
IFREMER Centre de Bretagne ZI Pointe du diable CS 10070 , PLOUZANE , 29280 , France
+33 (0)2 98.22.49.16
+33 (0)2 98.22.46.44
http://www.ifremer.fr/sismer/
Thèmes Sextant ( Thème )
  • /Milieu chimique/Colonne d'eau
GEMET - INSPIRE themes, version 1.0 ( Thème )
  • Répartition des espèces
Mots clés ( Thème )
  • évaluation
  • bon état écologique
  • chlorophylle
  • habitat pélagique
  • Données ouvertes
DCSMM : Descripteurs ( Thème )
  • D1: Biodiversité - Habitats pélagiques
Sous-regions marines ( Localisation )
  • /Métropole/Golfe de Gascogne
  • /Métropole/Manche mer du Nord
Cadre Réglementaire - SIMM ( Thème )
  • Directive Cadre pour la Planification de l'Espace Maritime (DCPEM)
  • Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin (DCSMM)
Type de jeux de donnée ODATIS ( Thème )
  • /Données dérivées/Indicateurs
Thématiques - SIMM ( Thème )
  • /Etat du Milieu/Biogéochimie
Limitation d'utilisation
Données sous Licence Creative Commons - Attribution (BY) : http://creativecommons.fr/licences/
Contraintes d'accès
Licence
Contraintes d'utilisation
Droit d’auteur / Droit moral (copyright)
Type de représentation spatiale
Vecteur
Dénominateur de l'échelle
100000
Langue
fr
Jeu de caractères
Utf8
Catégorie ISO
  • Biote
N
S
E
W


Date de début
2012
Date de fin
2016
Nom du système de référence
EPSG / WGS 84 (EPSG:4326) / 8.6
Type de géométries des objets
Polygone
Format (encodage)
  • ( )

Ressource en ligne
MC_trimestre1 ( OGC:WMS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Mer Celtique

Ressource en ligne
MC_trimestre1 ( OGC:WFS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Mer Celtique

Protocole
FILE
Nom
MC_trimestre1
Description
Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Mer Celtique
Ressource en ligne
DOI du jeu de données ( WWW:LINK-1.0-http--metadata-URL )

DOI du jeu de données

Ressource en ligne
MMN_trimestre1 ( OGC:WMS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Manche Mer du Nord

Ressource en ligne
MMN_trimestre1 ( OGC:WFS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Manche Mer du Nord

Protocole
FILE
Nom
MMN_trimestre1
Description
Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Manche Mer du Nord
Ressource en ligne
GdG_trimestre1 ( OGC:WMS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Golfe de Gascogne

Ressource en ligne
GdG_trimestre1 ( OGC:WFS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Golfe de Gascogne

Protocole
FILE
Nom
GdG_trimestre1
Description
Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Golfe de Gascogne
Ressource en ligne
MC_trimestre2 ( OGC:WMS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Mer Celtique

Ressource en ligne
MC_trimestre2 ( OGC:WFS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Mer Celtique

Protocole
FILE
Nom
MC_trimestre2
Description
Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Mer Celtique
Ressource en ligne
MMN_trimestre2 ( OGC:WMS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Manche Mer du Nord

Ressource en ligne
MMN_trimestre2 ( OGC:WFS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Manche Mer du Nord

Protocole
FILE
Nom
MMN_trimestre2
Description
Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Manche Mer du Nord
Ressource en ligne
GdG-trimestre2 ( OGC:WMS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Golfe de Gascogne

Ressource en ligne
GdG-trimestre2 ( OGC:WFS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Golfe de Gascogne

Protocole
FILE
Nom
GdG-trimestre2
Description
Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Golfe de Gascogne
Ressource en ligne
MC_trimestre3 ( OGC:WMS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Mer Celtique

Ressource en ligne
MC_trimestre3 ( OGC:WFS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Mer Celtique

Protocole
FILE
Nom
MC_trimestre3
Description
Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Mer Celtique
Ressource en ligne
MMN_trimestre3 ( OGC:WMS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Manche Mer du Nord

Ressource en ligne
MMN_trimestre3 ( OGC:WFS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Manche Mer du Nord

Protocole
FILE
Nom
MMN_trimestre3
Description
Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Manche Mer du Nord
Ressource en ligne
GdG_trimestre3 ( OGC:WMS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Golfe de Gascogne

Ressource en ligne
GdG_trimestre3 ( OGC:WFS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Golfe de Gascogne

Protocole
FILE
Nom
GdG_trimestre3
Description
Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Golfe de Gascogne
Ressource en ligne
MC_trimestre4 ( OGC:WMS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Mer Celtique

Ressource en ligne
MC_trimestre4 ( OGC:WFS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Mer Celtique

Protocole
FILE
Nom
MC_trimestre4
Description
Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Mer Celtique
Ressource en ligne
MMN_trimestre4 ( OGC:WMS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Manche Mer du Nord

Ressource en ligne
MMN_trimestre4 ( OGC:WFS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Manche Mer du Nord

Protocole
FILE
Nom
MMN_trimestre4
Description
Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Manche Mer du Nord
Ressource en ligne
GdG_trimestre4 ( OGC:WMS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Golfe de Gascogne

Ressource en ligne
GdG_trimestre4 ( OGC:WFS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Golfe de Gascogne

Protocole
FILE
Nom
GdG_trimestre4
Description
Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Golfe de Gascogne
Niveau
Jeu de données

Résultat de conformité

Date ( Publication )
2010-12-08
Explication
See the referenced specification
Généralités sur la provenance

Les indicateurs pour l’évaluation du bon état écologique des habitats pélagiques, ont été développés dans le cadre de la convention OSPAR par le groupe de travail « Intersessional Correspondence Group - Coordination of Biodiversity Assessment and Monitoring » (ICG-COBAM.

L’indicateur PH1 est basé sur la méthode du Plankton Index (PI, Gowen et al., 2013 ; Tett et al., 2013). En raison du manque de données complètes par paire de groupes fonctionnels et de la difficulté d’accessibilité de son script, le PH1 n’a pu être évalué pour l’évaluation 2018. En complément, une approche parallèle au PH1 (ratios à partir de données pigmentaires extraites à partir de la modélisation) a pu être proposée, pour une des paires de groupes fonctionnels, de façon à couvrir les différentes SRM. Cette approche n’est pas destinée à être généralisée à l’avenir, ni à remplacer le PH1. Elle est présentée à titre d’exemple, afin d’illustrer le potentiel de ce type de données pour renseigner un des couples fonctionnels (dinoflagellés/diatomées) qui permettront de calculer le PH1.

Le calcul de ce rapport dinoflagellés/diatomées s’est fait via la concentration en chlorophylle a. à partir des données issues de la modélisation par le modèle ECO-MARS3D ; par trimestre pour rendre compte de la phénologie des groupes d'espèces considérés. La métrique choisie est le percentile 90 de la concentration en chlorophylle a de chacun de ces groupes. Ce processus s’est fait au moyen de scripts informatiques écrits en langage R (https://cran.r-project.org/), il se passe en plusieurs étapes (Figure 4) :

1-Traitement des données de campagnes mesurées in situ pour obtenir des matrices géoréférencées.

2-Compilation de toutes les matrices (sous forme de raster NetCDF) comprises dans chaque trimestre pour la période d'évaluation (2012-2016).

3-Extraction des données (dinoflagellés et diatomées) de surface contenues dans chacune des UGE.

4-Calcul du percentile 90 par trimestre dans chacune de ces UGE pour synthétiser l’information à une échelle plus propice à l’interprétation et compatible avec le calcul des indicateurs.

5-Calcul du rapport dinoflagellés / diatomées par UGE

Source
  • 43e6824b-c98e-4e7b-b046-5299fa907304
  • c5dd9e6f-b45f-4cd6-984d-95d13c8d1f1f
Identifiant de la fiche
921f5fbb-4fca-49e7-ba1c-8ef2a9dbdcdd XML
Langue
fr
Jeu de caractères
Utf8
Type de ressource
Jeu de données
Date des métadonnées
2020-04-23T16:59:13
Nom du standard de métadonnées
ISO 19115:2003/19139 - SEXTANT
Version du standard de métadonnées
1.0
Point de contact
Ifremer -
 
 

Aperçus

Étendue spatiale

N
S
E
W


Mots clés

Données ouvertes bon état écologique chlorophylle habitat pélagique évaluation
Cadre Réglementaire - SIMM
Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin (DCSMM) Directive Cadre pour la Planification de l'Espace Maritime (DCPEM)
DCSMM : Descripteurs
D1: Biodiversité - Habitats pélagiques
GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
Répartition des espèces
Thèmes Sextant
/Milieu chimique/Colonne d'eau
Thématiques - SIMM
/Etat du Milieu/Biogéochimie
Type de jeux de donnée ODATIS
/Données dérivées/Indicateurs

Fourni par

Partager

Ressources associées

Not available


  •  
  •  
  •