/Biologie marine/Toxines
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Réseau de surveillance des phycotoxines dans les organismes marins (REPHYTOX) assure des prélèvements de coquillages dans un réseau de lieux de prélèvement répartis sur l’ensemble du littoral (environ 250 lieux potentiellement mobilisables). Les lieux de prélèvement REPHYTOX peuvent être communs avec des lieux REPHY. Les prélèvements peuvent concerner divers types de coquillages, en gisements naturels ou bien élevés selon des modes variés (bouchots, filières, tables, etc.). En tout état de cause, l’association entre lieux REPHYTOX et un certain nombre de lieux REPHY est étroite, les résultats REPHY pouvant déterminer le déclenchement de la recherche de toxines sur les lieux REPHYTOX de la zone. Ce jeu présente plusieurs fichiers de paramètres mesurés pour des types de toxines distincts entre 2006 et 2016 sur les lieux de surveillance : toxines amnésiantes (REPHYTOX-ASP) ; toxines paralysantes (REPHYTOX-PSP) ; et toxines lipophiles (REPHYTOX_LIP_AC et BE) avec les résultats des bio-essais (BE) et analyses chimiques (AC depuis 2010). A chaque paramètre de concentration mesuré sont associés le lieu de prélevement de l'échantillon, la date, le support, la fraction et la méthode utilisée.
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Le produit Surval « Données par paramètre » met à disposition les données d'observation et de surveillance bancarisées dans Quadrige pour le thème "Autres". Ces données correspondent aux données qui n’entrent pas dans les 7 autres thèmes (benthos dont récifs coralliens, contaminants chimiques et écotoxicologie, déchets, microbiologie, phytoplancton et hydrologie, ressources aquacoles et zooplancton). Quadrige bancarise des données de description de l’environnement marin et de la ressource conchylicole (hydrologie, chimie, biologie, déchets…). Ce SI est le système d’information de référence sur les eaux littorales du Système d’Information sur l’Eau (SIE). Son domaine d’activité s’ouvre aux données marines pour le Système d’Information sur le Milieu Marin (SIMM). Pour cela, les référentiels Quadrige s’appuient sur les référentiels nationaux du Service d’Administration Nationale des Données et Référentiels sur l’Eau (SANDRE) ainsi que sur ceux du Service d’Administration des Référentiels marins (SAR). La diffusion Surval comprend toutes les données qui sont validées dans le système d'information à l'exception des données qualifiées à "Fausses" et de quelques données sous moratoire. La publication des informations est journalière, une modification dans la base de donnée est donc disponible le lendemain. L'accès aux données d'observation se réalise par lieu. Un lieu de surveillance est un lieu géographique où des observations, des mesures et/ou des prélèvements sont rattachés. Il est décrit de façon unique par son emprise cartographique (surface, ligne ou point). Un lieu de mesure peut être utilisé par plusieurs programmes. Les coordonnées d'acquisition d'une information peuvent être précisées. Les données disponibles concernent les suivis du thème AUTRES. Il s’agit des paramètres associés à plusieurs suivis et à plusieurs autres groupes de paramètres (études d’impact, surveillance benthos/herbiers et chimie…). Elles correspondent aux données bancarisées dans Quadrige. La thématique met à disposition des données à partir de 2005 sur des lieux ponctuels et surfaciques. L'emprise géographique est nationale : la métropole et les départements et régions d'outre-mer (DROM).
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Le produit Surval « Données par paramètre » met à disposition les données d'observation et de surveillance bancarisées dans Quadrige pour le thème "Phytoplancton et Hydrologie". Quadrige bancarise des données de description de l’environnement marin et de la ressource conchylicole (hydrologie, chimie, biologie, déchets…). Ce SI est le système d’information de référence sur les eaux littorales du Système d’Information sur l’Eau (SIE). Son domaine d’activité s’ouvre aux données marines pour le Système d’Information sur le Milieu Marin (SIMM). Pour cela, les référentiels Quadrige s’appuient sur les référentiels nationaux du Service d’Administration Nationale des Données et Référentiels sur l’Eau (SANDRE) ainsi que sur ceux du Service d’Administration des Référentiels marins (SAR). La diffusion Surval comprend toutes les données qui sont validées dans le système d'information à l'exception des données qualifiées à "Fausses" et de quelques données sous moratoire. La publication des informations est journalière, une modification dans la base de donnée est donc disponible le lendemain. L'accès aux données d'observation se réalise par lieu. Un lieu de surveillance est un lieu géographique où des observations, des mesures et/ou des prélèvements sont rattachés. Il est décrit de façon unique par son emprise cartographique (surface, ligne ou point). Un lieu de mesure peut être utilisé par plusieurs programmes. Les coordonnées d'acquisition d'une information peuvent être précisées. Les données disponibles concernent les suivis du groupe de paramètres PHYTOPLANCTON (abondance et composition par dénombrement microscopique et cytométrie en flux, phycotoxines) et HYDROLOGIE (nutriments, oxygène dissous, salinité, température, turbidité). Elles correspondent aux données bancarisées dans Quadrige. Les programmes de surveillance mis en place œuvrent conjointement dans l’étude des forçages climatiques et anthropiques afin d’évaluer l’impact de spécificités locales (rejets urbains et industriels) ou d’apports diffus (lessivage des sols et élevage) provenant des bassins versants sur les recensements et proliférations phytoplanctoniques d’espèces toxiques ou nuisibles pour la faune marine et l’homme. La thématique met à disposition des données à partir de 1974 sur des lieux ponctuels et surfaciques. L'emprise géographique est nationale : la métropole et les départements et régions d'outre-mer (DROM).
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Le produit Surval "Données par paramètre" met à disposition les données d'observation et de surveillance bancarisées dans Quadrige, validées et qui ne sont pas sous moratoire. Ce système d'information contient des résultats sur la plupart des paramètres physiques, chimiques et biologiques de description de l'environnement. Les premières données datent par exemple de 1974 pour les paramètres de la qualité générale des eaux et les contaminants, 1987 pour le phytoplancton et les phycotoxines, 1989 pour la microbiologie, du début des années 2000 pour le benthos. Les données sous moratoire ou les données qualifiées "Faux" sont exclus de la diffusion Surval. Une donnée validée dans Quadrige aujourd’hui sera disponible dans Surval demain. L'accès aux données d'observation se fait par lieu. Un lieu de surveillance est un lieu géographique où des observations, des mesures et/ou des prélèvements sont effectués. Il est localisé de façon unique par son emprise cartographique (surface, ligne ou point). Un lieu de mesure peut être utilisé par plusieurs programmes d'observation et de surveillance. A compter du 29 avril 2021, conformément aux obligations de l’ « Open data », toutes les données validées sans moratoire sont diffusées à J+1 et sans traitement. Ainsi tous les paramètres et tous les programmes Quadrige sont diffusés, et regroupés sous forme de thème : - Benthos dont récifs coralliens - Contaminants chimiques et Écotoxicologie - Déchets - Microbiologie - Phytoplancton et Hydrologie - Ressources aquacoles - Zooplancton - Autres Un thème regroupe un ou plusieurs programmes d'acquisition. Un programme correspond à une mise en œuvre d'un protocole, sur une période et un ensemble de lieux. Chaque programme est placé sous la responsabilité d'un animateur. Pour accompagner le résultat, de nombreuses données sont diffusées (téléchargeables en tant que données d’observation), comme : - la description complète du « Paramètre-Support-Fraction-Méthode-Unité »; - la description complète des « Passages », « Prélèvements » et « Échantillons »; - le niveau de qualification du résultat; - une proposition de citation, afin d’identifier tous les organismes contribuant à cette observation. L'emprise géographique est nationale : la métropole et les départements et régions d'outre-mer (DROM). L'accès au téléchargement direct du jeu de données complet (~ 220 Mo) s'effectue par ce lien : https://sextant.ifremer.fr/documentation/surveillance_littorale/surval/data/surval.zip L'accès par la carte permet de configurer des extractions et des graphes de visualisation sur demande (email demandé pour le téléchargement). Pour en savoir plus : le vocabulaire employé sur ce site et dans les fichiers extraits est explicité dans des documents comme le dictionnaire et le manuel saisie Quadrige² ; les thématiques sont plus détaillées dans les consignes thématiques au utilisateurs. https://wwz.ifremer.fr/quadrige2_support/Mon-support-Quadrige/Je-consulte-les-manuels
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The definitive coastal information system, Quadrige stores coastal observation and monitoring network data. In order to manage coastal monitoring data, Ifremer developed the Quadrige² information system. Quadrige is one element of the Water Information System (SIE) http:// www.eaufrance.fr, et à ce titre, contribue aux travaux du Secrétariat d'Administration National des Données Relatives à l'Eau (SANDRE) http://www.sandre.eaufrance.fr. Quadrige Marine Zones is a reference source unique to the Quadrige system. It is used to break down the coast of the French mainland and overseas territories into large areas and to connect each one with observation and monitoring locations.