Cette étude s'inscrit dans le cadre du Programme INTERREG II, entre la région Corse et la région Toscane et, plus particulièrement, dans le sous-programme « Etude des herbiers de phanérogames en milieu lagunaire corse », géré par l'IFREMER. Elle a été menée conjointement avec une approche sur la « Mise en valeur des Lagunes Méditerranéennes », analyse intégrée dans le Programme National d'Océanologie Côtière, de l'IFREMER et du Ministère de l'Environnement.

En fonction de la profondeur, on distingue trois grands types de lagunes côtières :

- les lagunes profondes, qui favorisent le développement des populations de phytoplancton,

- les lagunes de faible profondeur, qui sont propices à l'installation d'une végétation aérienne,

- les lagunes intermédiaires (en profondeur), qui orientent leur production primaire soit vers le développement de phytoplancton soit vers le développement de macrophytes.

Les zones humides apparaissent comme des biotopes d'autant plus fragiles et convoités, que la frange côtière méditerranéenne est étroite et reste le site privilégié de nombreuses activités économiques et d'une urbanisation croissante. Ainsi, environ un million d'hectares de zones humides ont été détruit depuis une cinquantaine d'années. Malgré leur inscription sur la liste des sites de la Convention de Ramsar, les lagunes méditerranéennes ne bénéficient que rarement d'une protection effective, et restent particulièrement sensibles à la qualité du milieu environnant. En effet, les zones humides, ont souvent été considérées comme des zones insalubres, qu'il convenait d'assécher et ont fait l'objet d'opérations de démoustication au moyen de pesticides, pouvant affecter alors la qualité de ces milieux.

Aussi actuellement, une gestion de ces zones passe par l'établissement d'un état des connaissances concernant le milieu à gérer. En effet, il n'existe, à l'heure actuelle, que très peu de données pour guider les collectivités locales et les organismes responsables de la gestion des milieux. Il semble donc que certaines démarches soient indispensables pour l'aménagement de l'espace et la protection du milieu littoral. Il convient de disposer dans un premier temps, des informations sur les ressources présentes (inventaires faunistique et floristique) ainsi que sur leur localisation (cartographies).

Dans cette optique, le programme Interreg II s'intéresse à plusieurs lagunes continentales et à

3 lagunes corses (Biguglia, Diana et Urbino). Il vise à développer, conjointement avec le programme PNOC II :

- l'acquisition des connaissances environnementales, qui doivent permettre de mettre en place des outils d'aide à la décision pour la gestion de ces milieux lagunaires,

- les moyens de rendre accessibles aux citoyens responsables, les avancées scientifiques dans le domaine de l'environnement des lagunes,

- les bases écologiques nécessaires à une réflexion sur les moyens de connecter sciences humaines et sciences de la nature en relation avec le futur programme sur la Régulation de l'Accès à la Ressource de l'IFREMER.