Des prospections ont été effectuées à bord d’un bateau de 5 mètres sur toute la période d'étude. La majorité des prospections se fait en zone côtière, à moins de 6 miles des cotes, et dans des eaux de moins de 100 mètres de profondeur. Le choix du port de départ (Saint-Gilles, Saint-Leu, Saint-Pierre, Sainte-Rose, Sainte-Marie et Le Port) dépend de la météorologie locale et de la disponibilité des bateaux. Seules les prospections effectuées dans des conditions de mer à 3 sur l’échelle de Beaufort sont incluses dans l’analyse.

La vitesse moyenne du bateau est de 6 nœuds, permettant une prospection large de la zone, tout en conservant une détectabilité convenable. Les positions GPS, l’état de la mer et le statut de prospection sont notés toutes les 15 minutes. Deux à sept observateurs scrutent l’horizon à 180° à la recherche des cétacés. Lorsque des cétacés sont observés, différentes informations sont relevés sur une fiche de sortie terrain telles que la date, l’heure, la position GPS et l’état de la mer.

Un suivi focal est alors effectué afin de collecter toutes les informations relatives au groupe de cétacés observé (position GPS, espèce, nombre d’individus estimé, nombre de nouveaux nés et d’immatures, comportement, composition (pour les baleines à bosse), réaction au bateau, nombre de bateaux, individus a priori reconnus et autres commentaires). Le groupe est suivi jusqu’à ce que la majorité des individus aient été photo-identifiés avec un reflex numérique (Canon 10D, 20D, Nikon D5000) doté d’un objectif 75-300 mm. Pendant le suivi, les positions GPS sont notées toutes les 15 minutes. Une fois les individus photo identifiés et les données de suivi enregistrées, la prospection continue pour rechercher d’autres groupes de cétacés.

Les données de terrain sont ensuite bancarisées dans la base de données Globice sur Access version 2010. Les observations sont cartographiées sur QGIS 2.18.

Un code espèce est associé à chaque espèce et se décline comme suit : - 1: Ta, Tursiops aduncus, Le Grand Dauphin de l'Indo-Pacifique - 2 : Tt, Tursiops truncatus, Le Grand Dauphin - 3 : St, Stenella longirostris, Le Dauphin Long Bec - 4 : Sa, Stenella attenuata, Le Dauphin tacheté - 5 : Lh, Lagenodelphis hosei, Le Dauphin de Fraser - 6 : Pe, Peponocephala electra, Le Dauphin d'Electre - 7 : Gm, Globicephala macrorhynchus, Le Globicéphale Tropical - 8 : Mn, Megaptera novaeangliae, La Baleine à Bosse - 9 : Bb, Balaenoptera bonaerensis, Le Petit Rorqual Antartique - 10 : Oo, Orcinus orca, Orque - 11 : Pm, Physeter macrocephalus, Cachalot - 12 : NI, Non Identifié - 13 : Ea, Eubalaena australis, La Baleine Franche Australe - 14 : Md, Mesoplodon densirostris, La Baleine à Bec de Blainville - 15 : Zc, Ziphius cavirostris, La Baleine à Bec de Cuvier - 16 : Ks, Kogia sima, Cachalot Nain - 17 : Zi, Ziphiidae - 18 : Sc, Stenella coeruleoalba, Le Dauphin Bleu et Blanc.

Le découpage de l’espace utilisé est une grille standard de maille 2km*2km.

L’effort de prospection ainsi que les positions des différentes observations de cétacés sont cartographiés pour l'année de 2008 à 2015. Ces données sont alors reliées spatialement à la grille de maille 2km*2km.

Pour chaque maille, l'abondance relative de chacune des espèces est calculée pour l'année de 2008 à 2015. L'abondance relative est définie comme suit : Abondance relative = nombre d'individus estimé / nombre de kilomètres prospectés

La grille de l'abondance relative par année est obtenue et une symbologie propre lui est associé par espèce pour Tursiops aduncus, Le Grand Dauphin de l'Indo-Pacifique - Tursiops truncatus, Le Grand Dauphin - Stenella longirostris, Le Dauphin Long Bec - Stenella attenuata, Le Dauphin tacheté - Megaptera novaeangliae, La Baleine à Bosse - et les espèces rares qui regroupent toutes les autres espèces de cétacés rarement observées autour du littoral réunionnais.

Les mailles des grilles sont ensuite colorées selon la valeur de l'abondance relative de l'espèce en question (gradient colorimétrique croissant).