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DCSMM2018 - HP - D1C6 - Ratio de la concentration de surface en chlorophylle a contenue dans les dinoflagellés sur celle contenue dans les diatomées (2012-2016)

Le critère de définition du bon état écologique pour le descripteur D1 – Habitats pélagiques est le critère D1C6 : « les caractéristiques du type d'habitat, notamment sa structure biotique et abiotique et ses fonctions, ne subissent pas d'effets néfastes dus à des pressions anthropiques ». Un des indicateurs retenus, développés pour les communautés phyto- et zooplanctoniques, est l’indicateur PH1, basé sur la dynamique comparée de groupes fonctionnels (ou paires de formes de vie). Les échelles d’évaluation géographiques considérées sont les masses d’eau côtières de la Directive Cadre sur l’Eau (DCE) à la côte et les paysages marins mensuels au large, combinés sur une seule couche annuelle pour les besoins de l’évaluation. Le PH1 est en cours de développement et d’adaptation aux données disponibles dans les SRM, la période de référence et les seuils restent à définir pour cet indicateur. L’évaluation du bon état écologique n’a donc pu être effectué pour ce premier cycle DCSMM.

Les données sont présentées sous la forme de fichiers géoréférencés de type shapefile.

Simple

Date ( Creation )
2018
Identifier
DCSMM2018_CNRS_HP_D1C6_CHLOROPHYLLE_A_RATIO
Identifier
DOI:10.12770/921f5fbb-4fca-49e7-ba1c-8ef2a9dbdcdd
Credit
CNRS
Author
CNRS - Marie Duflos
Author
CNRS - Guillaume Wacquet
Author
CNRS - Anaïs Aubert
Author
CNRS - Isabelle Rombouts
Author
CNRS - Benoit Mialet
Author
Ifremer - David Devreker
Author
Ifremer - Alain Lefebvre
Author
CNRS - Luis Felipe Artigas
Publisher
Ifremer
IFREMER Centre de Bretagne ZI Pointe du diable CS 10070 , PLOUZANE , 29280 , France
+33 (0)2 98.22.49.16
+33 (0)2 98.22.46.44
http://www.ifremer.fr/sismer/
Thèmes Sextant ( Theme )
  • /Milieu chimique/Colonne d'eau
GEMET - INSPIRE themes, version 1.0 ( Theme )
  • Répartition des espèces
Keywords ( Theme )
  • évaluation
  • bon état écologique
  • chlorophylle
  • habitat pélagique
  • Données ouvertes
DCSMM : Descripteurs ( Theme )
  • D1: Biodiversité - Habitats pélagiques
Sous-regions marines ( Place )
  • /Métropole/Golfe de Gascogne
  • /Métropole/Manche mer du Nord
Cadre Réglementaire - SIMM ( Theme )
  • Directive Cadre pour la Planification de l'Espace Maritime (DCPEM)
  • Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin (DCSMM)
Type de jeux de donnée ODATIS ( Theme )
  • /Données dérivées/Indicateurs
Thématiques - SIMM ( Theme )
  • /Etat du Milieu/Biogéochimie
Use limitation
Données sous Licence Creative Commons - Attribution (BY) : http://creativecommons.fr/licences/
Access constraints
License
Use constraints
Copyright
Spatial representation type
Vector
Denominator
100000
Metadata language
fr
Character set
UTF8
Topic category
  • Biota
N
S
E
W
thumbnail


Begin date
2012
End date
2016
Reference system identifier
EPSG / WGS 84 (EPSG:4326) / 8.6
Geometric object type
Surface
Distribution format
  • ( )

OnLine resource
MC_trimestre1 ( OGC:WMS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Mer Celtique

OnLine resource
MC_trimestre1 ( OGC:WFS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Mer Celtique

Protocol
FILE
Name
MC_trimestre1
Description
Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Mer Celtique
OnLine resource
DOI du jeu de données ( WWW:LINK-1.0-http--metadata-URL )

DOI du jeu de données

OnLine resource
MMN_trimestre1 ( OGC:WMS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Manche Mer du Nord

OnLine resource
MMN_trimestre1 ( OGC:WFS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Manche Mer du Nord

Protocol
FILE
Name
MMN_trimestre1
Description
Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Manche Mer du Nord
OnLine resource
GdG_trimestre1 ( OGC:WMS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Golfe de Gascogne

OnLine resource
GdG_trimestre1 ( OGC:WFS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Golfe de Gascogne

Protocol
FILE
Name
GdG_trimestre1
Description
Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Golfe de Gascogne
OnLine resource
MC_trimestre2 ( OGC:WMS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Mer Celtique

OnLine resource
MC_trimestre2 ( OGC:WFS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Mer Celtique

Protocol
FILE
Name
MC_trimestre2
Description
Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Mer Celtique
OnLine resource
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Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Manche Mer du Nord

OnLine resource
MMN_trimestre2 ( OGC:WFS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Manche Mer du Nord

Protocol
FILE
Name
MMN_trimestre2
Description
Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Manche Mer du Nord
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Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Golfe de Gascogne

OnLine resource
GdG-trimestre2 ( OGC:WFS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Golfe de Gascogne

Protocol
FILE
Name
GdG-trimestre2
Description
Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Golfe de Gascogne
OnLine resource
MC_trimestre3 ( OGC:WMS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Mer Celtique

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Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Mer Celtique

Protocol
FILE
Name
MC_trimestre3
Description
Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Mer Celtique
OnLine resource
MMN_trimestre3 ( OGC:WMS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Manche Mer du Nord

OnLine resource
MMN_trimestre3 ( OGC:WFS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Manche Mer du Nord

Protocol
FILE
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MMN_trimestre3
Description
Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Manche Mer du Nord
OnLine resource
GdG_trimestre3 ( OGC:WMS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Golfe de Gascogne

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GdG_trimestre3 ( OGC:WFS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Golfe de Gascogne

Protocol
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GdG_trimestre3
Description
Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Golfe de Gascogne
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Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Mer Celtique

OnLine resource
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Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Mer Celtique

Protocol
FILE
Name
MC_trimestre4
Description
Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Mer Celtique
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Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Manche Mer du Nord

OnLine resource
MMN_trimestre4 ( OGC:WFS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Manche Mer du Nord

Protocol
FILE
Name
MMN_trimestre4
Description
Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Manche Mer du Nord
OnLine resource
GdG_trimestre4 ( OGC:WMS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Golfe de Gascogne

OnLine resource
GdG_trimestre4 ( OGC:WFS )

Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Golfe de Gascogne

Protocol
FILE
Name
GdG_trimestre4
Description
Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Golfe de Gascogne
Hierarchy level
Dataset

Conformance result

Date ( Publication )
2010-12-08
Explanation
See the referenced specification
Statement

Les indicateurs pour l’évaluation du bon état écologique des habitats pélagiques, ont été développés dans le cadre de la convention OSPAR par le groupe de travail « Intersessional Correspondence Group - Coordination of Biodiversity Assessment and Monitoring » (ICG-COBAM.

L’indicateur PH1 est basé sur la méthode du Plankton Index (PI, Gowen et al., 2013 ; Tett et al., 2013). En raison du manque de données complètes par paire de groupes fonctionnels et de la difficulté d’accessibilité de son script, le PH1 n’a pu être évalué pour l’évaluation 2018. En complément, une approche parallèle au PH1 (ratios à partir de données pigmentaires extraites à partir de la modélisation) a pu être proposée, pour une des paires de groupes fonctionnels, de façon à couvrir les différentes SRM. Cette approche n’est pas destinée à être généralisée à l’avenir, ni à remplacer le PH1. Elle est présentée à titre d’exemple, afin d’illustrer le potentiel de ce type de données pour renseigner un des couples fonctionnels (dinoflagellés/diatomées) qui permettront de calculer le PH1.

Le calcul de ce rapport dinoflagellés/diatomées s’est fait via la concentration en chlorophylle a. à partir des données issues de la modélisation par le modèle ECO-MARS3D ; par trimestre pour rendre compte de la phénologie des groupes d'espèces considérés. La métrique choisie est le percentile 90 de la concentration en chlorophylle a de chacun de ces groupes. Ce processus s’est fait au moyen de scripts informatiques écrits en langage R (https://cran.r-project.org/), il se passe en plusieurs étapes (Figure 4) :

1-Traitement des données de campagnes mesurées in situ pour obtenir des matrices géoréférencées.

2-Compilation de toutes les matrices (sous forme de raster NetCDF) comprises dans chaque trimestre pour la période d'évaluation (2012-2016).

3-Extraction des données (dinoflagellés et diatomées) de surface contenues dans chacune des UGE.

4-Calcul du percentile 90 par trimestre dans chacune de ces UGE pour synthétiser l’information à une échelle plus propice à l’interprétation et compatible avec le calcul des indicateurs.

5-Calcul du rapport dinoflagellés / diatomées par UGE

Source
  • 43e6824b-c98e-4e7b-b046-5299fa907304
  • c5dd9e6f-b45f-4cd6-984d-95d13c8d1f1f
File identifier
921f5fbb-4fca-49e7-ba1c-8ef2a9dbdcdd XML
Metadata language
fr
Character set
UTF8
Hierarchy level
Dataset
Date stamp
2020-04-23T16:59:13
Metadata standard name
ISO 19115:2003/19139 - SEXTANT
Metadata standard version
1.0
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Keywords

Données ouvertes bon état écologique chlorophylle habitat pélagique évaluation
Cadre Réglementaire - SIMM
Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin (DCSMM) Directive Cadre pour la Planification de l'Espace Maritime (DCPEM)
DCSMM : Descripteurs
D1: Biodiversité - Habitats pélagiques
GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
Répartition des espèces
Thèmes Sextant
/Milieu chimique/Colonne d'eau
Thématiques - SIMM
/Etat du Milieu/Biogéochimie
Type de jeux de donnée ODATIS
/Données dérivées/Indicateurs

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