Ce référentiel liste les références relatives aux espèces présentant un intérêt dans les domaines de la pêche et de l’aquaculture. Il provient du référentiel international ASFIS de la FAO. Il est donc possible d’y retrouver des espèces de poissons, de céphalopodes, de crustacés, de mollusques... Il ne liste pas l’ensemble des espèces mondiales, mais les espèces exploitées ainsi que les espèces impactées par l’exploitation de la ressource (mammifères marins, oiseaux, …). Cependant, dans Harmonie, il est étendu aux besoins des statistiques nationales en intégrant des données qui ne sont pas référencées dans les référentiels internationaux (exemples : la civelle, l’anguille jaune, l’anguille argentée).

La liste ASFIS est mise à jour une fois par an par la FAO et par la suite dans Harmonie. Le code 3A (code unique à 3 lettres), l’ISSCAAP/CSITAPA (identifiant de groupe d’espèces), le TAXOCODE (code taxonomique à 10 chiffres utilisé pour la classification) et la hiérarchie sont maintenues également dans Harmonie. Lors de la mise à jour annuelle un contrôle des références est fait en se rapportant au référentiel du Worms pour les espèces scientifiques et à l’Inventaire National du Patrimoine Naturel (INPN) pour les noms vernaculaires. Les modifications et ajouts sont envoyés à la FAO par le gestionnaire des référentiels.

Pour certaines espèces, des coefficients de conversion appelés équivalent poids vifs permettent d’estimer le poids d’un poisson vivant à partir de son poids après transformation. Dans Harmonie, il existe également un lien avec le référentiel des espèces scientifiques pour permettre le rapportage et le croisement de données entre les différentes actions de collecte. Par ailleurs, pour limiter les erreurs de saisie, les espèces commerciales peuvent être régionalisées en fonction des zones en mer ou des régions. Ainsi, une espèce observée uniquement en Méditerranée ne pourra pas être saisie en Guyane.