L'année 2015 est une année de transition initiant l’évolution des modalités de surveillance de la santé des mollusques marins mise en œuvre par l’Ifremer. Le dispositif de surveillance constitué de 4 axes répond à deux objectifs.

Trois axes sont mis en place pour répondre au premier objectif .

La surveillance planifiée des mortalités et des maladies de l’huître creuse Crassostrea gigas s’appuyant sur le réseau RESCO 2.

La surveillance planifiée des mortalités et des maladies de la moule bleue Mytilus edulis s’appuyant sur le réseau MYTILOBS 2. Ces deux réseaux se basent sur un suivi régulier d’indicateurs de santé chez les animaux sur des sites ateliers.

La surveillance événementielle des mortalités des autres espèces de mollusques marins (moule Mytilus galloprovincialis comprise) s’appuyant sur le réseau REPAMO 2.Ce réseau, se base sur la déclaration de mortalités des conchyliculteurs ou des pêcheurs professionnels aux services déconcentrés de l’Etat, les Directions Départementales des Territoires et de la Mer (DDTM).Un axe est mis en place pour répondre au deuxième objectif. La surveillance planifiée, ciblée et fondée sur le risque d’introduction et d’installation de Microcytos mackini chez l’huître creuse Crassostrea gigas s’appuyant sur le réseau RESCO 2. Cette surveillance se base sur un suivi régulier du site atelier de Loix-en-Ré. La surveillance s'applique à des populations de coquillages d'intérêt commercial que ce soient des populations d'élevage ou des populations sauvages du littoral français.

L'unité épidémiologique peut être une concession ou un parc ostréicole, une écloserie - nurserie, un gisement naturel, une zone ou une partie de zone. Toutes les unités épidémiologiques peuvent faire l'objet d'un échantillonnage en fonction du protocole d’épidémiosurveillance considéré.Les données collectées dans le cadre du réseau REPAMO 2 sont de deux types : des informations concernant le prélèvement (commémoratifs) et des résultats d'analyses. Pour chaque protocole d’épidémiosurveillance, les commémoratifs sont collectés de manière systématique par des correspondants de terrain Ifremer en s’appuyant sur des questionnaires élaborés sous démarche qualité. Les animaux prélevés sont analysés par la cellule analytique du Laboratoire de pathologie et de génétique Ifremer de La Tremblade. La méthode analytique de référence préconisée pour la détection des organismes pathogènes des maladies réglementées est l’histo-pathologie. L'effectif analysé permet de compenser la faible sensibilité et spécificité de cet outil, notamment sur des agents infectieux autres que parasitaires. D'autres outils de diagnostic sont utilisés en complément, principalement des techniques de biologie moléculaire telles que la PCR mais également la culture (bactérienne par étalement – isolement de souches majoritaires, parasitaire en milieu thioglycollate), l'hybridation in situ, la microscopie électronique à transmission, la caractérisation d’espèces par séquençage.

Type de données :

le cadre du réseau ont permis dans certains cas de découvrir de nouveaux agents infectieux directement associés à de la mortalité (Vibrio harveyi sur Haliotis tuberculata par exemple) et de mettre en évidence la présence en France d'agents infectieux considérés jusqu'alors comme exotiques (Perkinsus olseni, Haplosporidium nelsoni, Bonamia exitiosa). Des différences de sensibilité vis-à-vis d'un agent pathogène ont pu être mises en évidence entre populations d'une même espèce.

Nombre de points d'observation ou de mesure :

non prévisible : dépend des déclarations des conchyliculteurs/pécheurs

Précision sur le type de donnée :

Étude des hausses de mortalité : Maintenir un état de veille à l’égard de toute maladie infectieuse affectant les mollusques

Paramètre(s) observé(s) ou mesuré(s) :

Tout organisme pathogène, en particulier ceux réglementés (par l'OIE, l'UE et la France), et les agents infectieux émergents

Résolution du (ou des) paramètre(s) :

30 moribonds et 30 vivants

Fréquence d'actualisation :

continue

Fréquence d'observation :

Variable