La production primaire du Bassin d’Arcachon est dominée par les herbiers de zostères en zone intertidale. Avec la production du microphytobenthos et du phytoplancton, cette activité photosynthétique est un puit de CO2 atmosphérique et la source de matière organique majeure dans le milieu aquatique. Les quelques mesures de production (lumière) et de respiration (obscurité) réalisées jusqu’ici l’ont été à l’aide de chambres benthiques émergées (marée basse) et immergées (marée haute) qui restent lourdes à déployer et intègrent mal la variabilité spatiale et temporelle (saison, jour/nuits, marée) du milieu. L’objectif de ce travail est d’utiliser des mesures automatisées de flux de CO2 par Eddy-covariance pour appréhender la production nette de l’écosystème intertidal. Cette méthode de référence dans les écosystèmes terrestres, mais qui n’a jamais été appliquée au milieu côtier, est la seule permettant d’intégrer de manière satisfaisante les variations de marée et d’ensoleillement.