Les microorganismes sont des indicateurs de la qualité des milieux naturels (bactéries indicatrices d’un risque associé à l’usage de ces milieux et/ou d’une ressource exploitée) ; mais ils sont également des acteurs dans la transformation de la matière biogène et la dégradation / immobilisation de composés à forte toxicité déversés par les activités humaines. Enfin les microorganismes sont en interaction avec d’autres organismes du milieu : flores symbiontes, commensales ou pathogènes qui peuvent affecter, positivement ou négativement, la dynamique de population des organismes considérés. En zone marine côtière l’habitat benthique occupe une place particulière. Les sédiments, réceptacles des apports de la colonne d’eau constituent un support au développement d’une communauté de micro et de macroorganismes qui interagissent. Le projet abordera deux questions : quelle est la flore bactérienne associée à des macroorganismes benthiques remaniant le sédiment ? en quoi peut–elle être influencée par les communautés procaryotes présentes dans le sédiment ? On s’intéressera de façon non exclusive à la zone intertidale du Bassin d’Arcachon et à deux bivalves : la coque et la palourde. A côté de la flore procaryote (bactéries et archées), une attention sera également portée aux bactéries indicatrices de contamination fécale (E. coli ou entérocoques) qui peuvent (i) trouver dans les sédiments un habitat propice à leur survie ou (ii) y être localement introduites en masse (zones à forte fréquentation aviaire par exemple).

Base de données sur la macrofaune benthique invertébrée d'une station échantillonnée dans le Bassin d'Arcachon depuis le 11 décembre 2006.

Ces données résultent de la compilation de cartes historiques des peuplements benthiques (Rebent). Les peuplements sont classés selon la typologie EUNIS 2004, et à chaque peuplement un indice de richesse est attribué en fonction de la biomasse, de l'abondance et de la richesse spécifique. Les données utilisées sont parfois anciennes donc un indice de fiabilité a été ajouté pour pondérer l'information.

Jeu de photographies couleurs réalisées en octobre 2007 dans le cadre de l'étude de l'impact du creusement de la Souille de le Dispute dans le Bassin d'Arcachon (cf. fiche métadonnée:Impact du creusement de la nouvelle souille de la Dispute sur les peuplements benthiques)

Base de données sur la macrofaune benthique invertébrée de quatre stations échantillonnées dans le Bassin d'Arcachon dans le cadre de la Directive Cadre sur l'Eau (DCE).

Cartes de la macrofaune benthique invertébrée réalisées à partir de 182 stations échantillonnées dans le Bassin d'Arcachon en 2001-2002.

Base de données sur la macrofaune benthique invertébrée de 182 stations échantillonnées dans le Bassin d'Arcachon en 2001-2002.

Évolution saisonnière de la physiologie des huîtres et intégration alimentaire. Comparaison des huîtres d’origine cultivées ou sauvages.

Évolution temporelle des communautés benthiques et paramètres sédimentaires associés au récif naturel d’huîtres, des tables ostréicoles et de témoin sans huîtres.

Une indication sur l’adéquation des outils à la reconnaissance des ressources benthique a été représentée sur les cartes des zones d’intérêt. Cette indication donne une information sur la fiabilité du résultat.