La rivière Ponteil draine le centre d'enfouissement des déchets d'Audenge. En aval de la décharge, la nappe phréatique chargée en ammonium et en chlorure alimente la rivière. Ceci se traduit par un flux de 10tonnes d'azote par an dans le Bassin d'Arcachon.

Depuis septembre 2007, un programme de recherche est en cours sur le cycle du carbone dans le bassin d’Arcachon. Une des différentes actions menées dans ce projet consiste à comprendre et quantifier les flux de carbone organique et inorganique transportés par les rivières alimentant la lagune. Ce point a fait l’objet d’un échantillonnage bi-mensuel depuis entre février 2008 et février 2009. L’objectif est aussi de comparer le flux de carbone biogénique exporté par la nappe phréatique plioquaternaire dans le bassin versant Leyre-Arcachon avec la production primaire forestière du bassin versant et aquatique du Bassin d’Arcachon lui-même.