Évaluation directe du stock de coquilles saint jacques (Pecten maximus) de la baie de Seine. Le projet de rattachement est SIH.

Observations marines et sous-marins de l'état des paysages sous marins et des pressions

Jusqu’en 1997, parmi les réseaux nationaux de suivi du milieu littoral existants, aucun ne prenait en compte la problématique portuaire. Or, les activités pratiquées dans les ports maritimes influent sur la qualité du milieu aquatique malgré les mesures de prévention mises en place sans toutefois que leur impact soit réellement bien connu. C’est pourquoi, par circulaire du 7 mars 1997, le ministère du Développement durable a mis en place le Réseau national de surveillance de la qualité des eaux et des sédiments des ports maritimes, dénommé REPOM. Ce dernier a été constitué à partir des réseaux départementaux de suivi de la qualité des ports que géraient les Cellules Qualité des Eaux Littorales (CQEL).

Réseau national de surveillance de l'état de santé des peuplements de mollusques sur les gisements naturels ou dans les zones de production conchylicole. Il assure une mission réglementaire et une activité de service public déléguée par le Ministère de l'agriculture et de la pêche à travers la DGAL (Direction générale de l'alimentation).

Création en 2015, faisant suite au RESCO mis en place en 2009, et au REMORa mis en place en 1993. En 2015, la structure et le fonctionnement de l’ancien réseau RESCO a été utilisée afin d’appliquer une surveillance planifiée sur les huîtres creuses. Plus précisément, les lots sentinelles utilisés par le réseau, représentant 3 classes d’âge (6 mois, 18 mois conservés de l’année précédente et 30 mois conservés de l’année précédente) sont suivis régulièrement (fréquence bi-mensuelle à mensuelle) tout au long de l’année sur 12 sites ateliers nationaux (correspondant aux sites anciennement RESCO). Lors de chaque passage, des dénombrements sont effectués afin d’évaluer le taux de mortalité, et différents types d’analyses diagnostiques de laboratoire seront réalisés : - au temps initial, les nouveaux lots de naissain (Naissains Standardisés Ifremer) subiront des analyses spécifiques par PCR afin de rechercher les agents infectieux potentiellement présents (OsHV-1 et Vibrio aestuarianus) mais aussi des analyses non spécifiques (histologie, bactériologie classique ) pour la détection éventuelle d’autres agents pathogènes - pour la détection de maladies émergentes, les premiers lots moribonds détectés pour chaque classe d’âge, pour chaque site, subiront des analyses diagnostiques de laboratoire spécifiques (PCR OsHV-1 et Vibrio aestuarianus) et non spécifiques (histologie) afin de déceler le plus précocement possible d’éventuelles maladies émergentes sur ces lots sentinelles - pour la détection de maladie exotique, en l’absence de hiérarchisation des maladies exotiques des huîtres creuses disponible, le parasite Mikrocytos mackini a été choisi pour être surveillé car l’infection par ce parasite est réglementée au niveau européen, sur l'un des sites du RESCOII (Loix en Ré) identifié préalablement comme un site à risque vis à vis de l'introduction de ce parasite. Parallèlement à ces suivis de mortalités et ces analyses diagnostiques de laboratoire, chaque site est équipé de sonde permettant l’acquisition de paramètres environnementaux (température, pression, salinité) à haute fréquence. Les différents résultats sont bancarisés dans la base Quadrige², et sont disponibles pour les différents acteurs concernés. Le réseau est adossé à un site internet dédié permettant la diffusion des objectifs, des protocoles et des résultats, et sera mis à jour tous les mois. Parallèlement, des bulletins d’information synthétisant les résultats obtenus sont diffusés par mail tous les mois aux services de l’Etat.

Dans le cadre de l’implantation d’une centrale électronucléaire sur le littoral de la commune de Flamanville, Electricité de France a confié à l’Ifremer les études écologiques et halieutiques aux abords du site. L’une des expertises consiste à réaliser chaque année deux campagnes de pêche des crustacés. Leurs objectifs est le suivi des fluctuations naturelles des principaux indicateurs retenus lors de la mise en route de la centrale et d’évaluer l’impact de celle-ci sur la pêcherie environnante.

Les données mises à disposition représentent le référentiel des lieux de surveillance de la base Quadrige. Les données présentées respectent le scénario d'échange "Qualité des eaux littorales" décrit par le Sandre. Les lieux touchés par un moratoire sont exclus de cette diffusion. Un lieu d'observation dans Quadrige est un lieu géographique où il est prévu de faire des observations, des mesures et/ou des prélèvements. Il est localisé de façon unique par son emprise cartographique (surface, ligne ou point). Un lieu de mesure peut être utilisé par plusieurs programmes. Pour gérer les données de la surveillance du littoral, l'Ifremer a développé le système d'information Quadrige, qui associe à une base de données une panoplie d'outils d'interprétation et d'élaboration de produits d'information. Quadrige constitue un élément du Système d'Information sur l’Eau (SIE) www.eaufrance.fr, et à ce titre, contribue aux travaux du Service d'Administration National des Données Relatives à l'Eau (Sandre) www.sandre.eaufrance.fr. La banque thématique Quadrige a pour mission première la gestion et la valorisation des données issues des réseaux d'observation et de surveillance du littoral. Au niveau national, Quadrige est aujourd'hui désigné par le ministère en charge de l'environnement comme le système d'information de référence pour les eaux littorales, et s’inscrit comme un outil commun aux différents acteurs de l’environnement marin. La banque Quadrige est constituée des données de la base Quadrige et des produits décrits ou mis à disposition sur le site internet Envlit. La base Quadrige contient des résultats sur la plupart des paramètres physiques, chimiques et biologiques de description de l'environnement, ainsi que l'observation des déchets marins. Les premières données datent par exemple de 1974 pour les paramètres de la qualité générale des eaux et les contaminants, 1987 pour le phytoplancton et les phycotoxines, 1989 pour la microbiologie, du début des années 2000 pour le benthos. Elles sont mises à jour en permanence.

Système d'information de référence sur les eaux littorales, Quadrige bancarise les données des réseaux d'observation et de surveillance des eaux littorales. Pour gérer les données d'observation et de surveillance de l'environnement marin et littoral, l'Ifremer a développé le système d'information Quadrige. Quadrige constitue un élément du Système d'Information sur l'Eau (SIE) http://www.eaufrance.fr, et à ce titre, contribue aux travaux du Secrétariat d'Administration National des Données Relatives à l'Eau (SANDRE) http://www.sandre.eaufrance.fr. Les zones marines Quadrige est un référentiel propre au système Quadrige. Il permet de découper le littoral français (métropole et outre-mer) en grandes zones et d'y rattacher les lieux d'observation et de surveillance.

Le produit Surval "Inventaire des lieux actifs" présente l’inventaire des lieux programmés actuellement pour un suivi. Ils donnent donc accès à la programmation des réseaux (un lieu dont la période d’activité dans Quadrige inclue la date du jour est considéré actif pour le programme). Pour accéder aux données d'observation, il faut passer par les lieux du produit Surval 'Données par paramètre". Le REPHY est un réseau national couvrant le littoral métropolitain et sur les DOMs Martinique, Guadeloupe, Réunion et Mayotte. Il a pour objectifs : - d'observer l'ensemble des espèces phytoplanctoniques des eaux côtières, et recenser les événements tels que les eaux colorées, les efflorescences exceptionnelles et les proliférations d'espèces toxiques ou nuisibles pour la faune marine, - de surveiller plus particulièrement les espèces produisant des toxines dangereuses pour les consommateurs de coquillages. Ces objectifs sont complémentaires, puisque la surveillance régulière de l'ensemble des espèces phytoplanctoniques permet la détection des espèces toxiques et nuisibles connues, mais également d'espèces potentiellement toxiques. C'est la présence de ces espèces toxiques dans l'eau qui déclenche la surveillance des toxines dans les coquillages. Le REPHY a pour mission de surveiller les coquillages dans leur milieu naturel (parcs, gisements). Pour les coquillage sortis du milieu marin (c'est à dire dans les établissements d'expédition conchylicoles, sur les marchés, avant l'exportation), des plans nationaux de surveillance et de contrôle sont organisés par la Direction Générale de l'Alimentation du ministère de l'Agriculture. Les analyses sont effectuées par les laboratoires départementaux vétérinaires agréés, qui sont encadrés par le Laboratoire National de Référence, de l'Agence Française de Sécurité Sanitaire des Aliments

Le produit Surval "Inventaire des lieux actifs" présente l’inventaire des lieux programmés actuellement pour un suivi. Ils donnent donc accès à la programmation des réseaux (un lieu dont la période d’activité dans Quadrige inclue la date du jour est considéré actif pour le programme). Pour accéder aux données d'observation, il faut passer par les lieux du produit Surval 'Données par paramètre". Le réseau national (REMI) comprend un dispositif de surveillance régulière et un dispositif d'alerte : - Le dispositif de surveillance régulière vérifie que le niveau de contamination microbiologique de chaque zone de production reste conforme au classement défini dans les arrêtés préfectoraux et dépistent les épisodes inhabituels de contamination. - Le dispositif d'alerte est déclenché par les résultats de la surveillance qui dépassent ou risquent de dépasser les normes définissant les classes de qualité, ou en cas de risque de contamination (rejet polluant, orage), voire d'épidémie constatée ou présumée d'origine coquillière.