SACROIS est un algorithme de croisement de données qui produit des séries de données d’activité de la pêche professionnelle (données de production et d’effort validées, consolidées et qualifiées) pour les navires inscrits au fichier Flotte de Pêche Communautaire (FPC). SACROIS sélectionne le meilleur parti des sources d’informations disponibles pour produire les données d’activité de pêche de référence. SACROIS consiste en une application opérationnelle de rapprochement, vérification et contrôles de cohérence de différents flux unitaires de données. L’algorithme SACROIS ne corrige pas la donnée, il a pour objectif de : - fournir la meilleure estimation possible des différents éléments constituant une marée à partir des sources de données disponibles, - identifier les incomplétudes des différentes sources de données et en proposer une synthèse complétée par des indicateurs de qualification de la donnée issus des croisements. Ainsi l’algorithme SACROIS produit deux fois par mois une nouvelle source de données ; synthèse de l’ensemble des sources de données disponibles : les marées SACROIS reconstituées. Les données SACROIS ont été calculées depuis 2000 pour toutes les flottilles pour lesquelles des données sont disponibles : - Mer du Nord – Manche – Atlantique (hors senneurs tropicaux), - Méditerranée (hors senneurs à thons rouges), - DOM (La Réunion, Mayotte, Guyane et Antilles).

Dans le cadre de l’implantation d’une centrale électronucléaire sur le littoral de la commune de Flamanville, Electricité de France a confié à l’Ifremer les études écologiques et halieutiques aux abords du site. L’une des expertises consiste à réaliser chaque année deux campagnes de pêche des crustacés. Leurs objectifs est le suivi des fluctuations naturelles des principaux indicateurs retenus lors de la mise en route de la centrale et d’évaluer l’impact de celle-ci sur la pêcherie environnante.

Depuis 2001, une évaluation annuelle des stocks de palourdes japonaise (Ruditapes philippinarum) et croisée d'Europe (Ruditapes decussatus) est réalisée en mars dans le golfe du Morbihan et la rivière Noyalo. Les objectifs de cette enquête sont : 1) l'estimation par évaluation directe, de la biomasse du stock et de sa répartition géographique; 2) estimer la biomasse exploitable et le potentiel d'exploitation des sites échantillonnés en particulier, dans les zones réservées à la pêche professionnelle; 3) établir un diagnostic, avec une vision à moyen terme, sur l'état du stock; 4) proposer la mise en œuvre de mesures de gestion appropriées. Deux campagnes ont également été réalisées en 1996 et 1997.

Ces campagnes qui ont eu lieu sur la Thalia, ont pour but d’évaluer l’abondance du stock de coquilles Saint-Jacques dans les Pertuis Charentais.

L'objectif de cette campagne qui se déroule en Manche - Baie de somme depuis 1980, sur 5 jours en septembre, est d'évaluer les fluctuations naturelles pluriannuelles des peuplements et d'analyser l'incidence éventuelle de la centrale nucléaire sur le milieu marin et les ressources. Elle permet de déterminer des indices annuels d'abondance et une répartition des poissons plats et autres espèces (crevettes grises, tacauds, merlan).

Les campagnes COMOR, qui ont eu lieu sur la Thalia, ont pour but d'évaluer l'abondance du stock de coquilles Saint-Jacques (et le cas échéant de déterminer la présence d'une algue toxique) en baie de Seine.

Le projet NourDem vise à réaliser des campagnes annuelles de chalutage dans les trois estuaires de la Seine, de la Loire et de la Gironde.

Dans le cadre de la mise en oeuvre du programme de surveillance de la directive cadre stratégie pour le milieu marin (DCSMM), le suivi des poissons et céphalopodes démersaux des milieux meubles côtiers a été jugé prioritaire. Des campagnes annuelles d'observation des nourriceries côtières sur fonds meubles ont été menées par le Laboratoire Halieutique Méditerranée de la station Ifremer de Sète. Les objectifs de ces campagnes sont : 1. Évaluer par chalutage la densité, la biomasse et la distribution des poissons et des céphalopodes et en particulier les juvéniles benthiques et démersaux (rougets, grondins,). Pour cela, une centaine de chalutages standardisés ont été menés sur l’ensemble de la bande côtière du Golfe du Lion située entre 5m et 40m de profondeur. 2. Mesurer systématiquement la taille des individus collectés de façon à caractériser l’importance de la fonction nourriceries dans les zones observées et mieux comprendre la dynamique de population des espèces locales. 3. Mieux connaitre l'écosystème des zones côtières en identifiant systématiquement l’ensemble des espèces rencontrées (y compris les invertébrés benthiques et pélagiques autres que poissons et céphalopodes), des macro-déchets observés et en caractérisant leurs habitats hydrologiques (CTD, oxygène, fluorescence, pH, turbidité,…).

Les 62 campagnes RESSGASC permettent l'évaluation trimestrielle des quantités de diverses espèces (merlu, sole, langoustine, etc.) rejetées par les navires de pêche (individus n'ayant pas atteint la taille légale de débarquement). Ces informations, ainsi que les données collectées à partir de la structure démographique des débarquements (à l'aide d'échantillons provenant des criées), sont essentielles pour l'évolution des stocks de poissons commerciaux.

La campagne du CGFS vise à recueillir des données de base pour estimer l'état des ressources halieutiques, par une évaluation directe de l'abondance et de la distribution des stocks, ainsi que par un échantillonnage biologique des prises commerciales. La campagne CGFS est réalisée dans le cadre de ce programme au projet européen Contractualisation de la collecte des données halieutiques de base (DCF). Les indices d’abondance recueillis lors de cette campagne sont utilisés par le groupe de travail international du CIEM « Pêcheries démersales de mer du Nord, Manche Est et Skagerrak » et complètent les données issues des campagnes anglaises « Beam Trawl Survey » pour le groupe de travail « Poissons plats ».